Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb3O35393 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb3O35393 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efnb3O35393 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb3O35393 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb3O35393 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb3O35393 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efnb3O35393 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.6 ms