Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rundc3aO08576 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rundc3aO08576 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rundc3aO08576 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms