Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shisa8J3QNX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Shisa8J3QNX5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms