Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28051J3QMA2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28051J3QMA2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.3 ms