Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc144bE9PVZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms