Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ino80eA0A0U1RP99 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ino80eA0A0U1RP99 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ino80eA0A0U1RP99 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ino80eA0A0U1RP99 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ino80eA0A0U1RP99 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ino80eA0A0U1RP99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms