Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm6S4R1W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbm6S4R1W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm6S4R1W5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms