Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo1Q9Z132 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rspo1Q9Z132 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms