Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms