Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkraQ9WTX2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkraQ9WTX2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkraQ9WTX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms