Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d3cQ9QZS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh2d3cQ9QZS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d3cQ9QZS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms