Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PnkpQ9JLV6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PnkpQ9JLV6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms