Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmQ9JJ72 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmQ9JJ72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms