Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc12a4Q9JIS8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc12a4Q9JIS8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc12a4Q9JIS8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms