Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SgshQ9EQ08 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SgshQ9EQ08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms