Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a1Q9EPE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a1Q9EPE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms