Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr4Q9EP82 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr4Q9EP82 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr4Q9EP82 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms