Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubiad1Q9DC60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubiad1Q9DC60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubiad1Q9DC60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms