Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700018B08RikQ9DA83 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700018B08RikQ9DA83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700018B08RikQ9DA83 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700018B08RikQ9DA83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms