Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D8N1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8N1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D8N1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D8N1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D8N1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms