Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PirQ9D711 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PirQ9D711 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PirQ9D711 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PirQ9D711 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PirQ9D711 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PirQ9D711 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PirQ9D711 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PirQ9D711 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PirQ9D711 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms