Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Speer4f1Q9D5Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms