Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5K4

S100pbp, S100P-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100pbpQ9D5K4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S100pbpQ9D5K4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
S100pbpQ9D5K4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
S100pbpQ9D5K4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms