Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D3J9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D3J9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D3J9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D3J9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms