Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms