Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syf2Q9D198 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syf2Q9D198 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms