Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zcchc8Q9CYA6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zcchc8Q9CYA6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc8Q9CYA6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms