Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc17Q9CXD9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc17Q9CXD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc17Q9CXD9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms