Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snrpb2Q9CQI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpb2Q9CQI7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms