Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SncaipQ99ME3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SncaipQ99ME3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SncaipQ99ME3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms