Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gps1Q99LD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gps1Q99LD4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms