Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sdcbp2Q99JZ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdcbp2Q99JZ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdcbp2Q99JZ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms