Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim7Q923T7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim7Q923T7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms