Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelenomQ8VHC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SelenomQ8VHC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SelenomQ8VHC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms