Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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