Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc12Q8R344 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc12Q8R344 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms