Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZX0

Sbk1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk1Q8QZX0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbk1Q8QZX0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbk1Q8QZX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbk1Q8QZX0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbk1Q8QZX0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbk1Q8QZX0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbk1Q8QZX0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms