Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ClasrpQ8CFC7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClasrpQ8CFC7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ClasrpQ8CFC7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms