Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph6aQ8CDR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rsph6aQ8CDR2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph6aQ8CDR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms