Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol7cQ8C6E1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apol7cQ8C6E1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol7cQ8C6E1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms