Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl3Q8BVF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl3Q8BVF2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms