Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M10.4Q85ZW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms