Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrsam1Q80ZI6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrsam1Q80ZI6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrsam1Q80ZI6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms