Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RubcnQ80U62 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RubcnQ80U62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RubcnQ80U62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms