Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifna12Q80SS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna12Q80SS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifna12Q80SS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms