Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smchd1Q6P5D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smchd1Q6P5D8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smchd1Q6P5D8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms