Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gpbp1Q6NXH3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpbp1Q6NXH3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms