Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ttf1Q62187 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ttf1Q62187 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Ttf1Q62187 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ttf1Q62187 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ttf1Q62187 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ttf1Q62187 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttf1Q62187 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttf1Q62187 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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