Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim25Q61510 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim25Q61510 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms