Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf38aQ4FK66 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf38aQ4FK66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf38aQ4FK66 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms